其他領域

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張源俊 研究員
楊欣洲 研究員
  • 專長：
      • 遺傳與基因體統計、生物資訊
    工具列表：
      • 微陣列生物晶片之混合型去氧核醣核酸實驗資料分析軟體 (MPDA)：MPDA 主要設計來分析以單一核苷酸多型性生物晶片所進行的混合去氧核醣核酸實驗所產生之資料。功能含括訊息的擷取、不等雜交放大率的定量、等位基因頻率的估計、單點與多點關聯性基因定位等等。（說明網頁）
      • 等位基因頻率與不等雜交放大率資料庫 (Databases of AF and CPA)：本資料庫提供了不同平台的單一核苷酸多型性生物晶片下，歐、亞、非人種的等位基因頻率與不等雜交放大率的資訊。可提供使用者在分析單一核苷酸生物晶片雜交強度和等位基因頻率時重要的訊息。（說明網頁）
      • 單一核苷酸多型性生物晶片品質監控軟體 (SAQC )：SAQC 主要設計來分析單一核苷酸多型性生物晶片所產生之基因型資料與雜交強度資料。可提供單一核苷酸生物晶片資料的呈現與品質檢驗。（說明網頁）
      • 同型合子分析軟體 (LOHAS)：LOHAS 主要設計來分析基因型資料。功能上可協助使用者定位基因體中與疾病相關的同型合子片段，也可協助找到族群中特有的同型合子區段。（說明網頁）
      • 生物標記尋找與樣本分群軟體 (BIASLESS)：BIASLESS主要設計來分析各類體學資料與臨床變數資料。功能上可協助使用者分析體學資料來找出重要可預測疾病的生物標記並進行預測。（說明網頁）
      • 數量性狀資料庫 (Program and databases of gene-based eQTL)：本資料庫提供了歐、亞、非人種的基因表現數量基因座的資訊。可提供使用者在完成全基因體關聯性研究之後，進一步探討所發現的重要單一核苷酸多型性是否會調控基因表現。（說明網頁）
      • 等位基因頻率、同型合子、等位不平衡與考倍數分析軟體 (ALICE)：ALICE主要設計來分析單一核苷酸多型性生物晶片所產生之基因型資料與雜交強度資料。可提供使用者進行全基因體等位基因頻率的估計，並可用以定位病人或是正常人的基因體中，同型合子、等位不平衡、考倍數變異所在的基因體片段。(說明網頁)
      • 統計代謝體分析軟體 (SMART)：SMART主要設計來分析質譜儀所產生之各種格式代謝體資料（原始檔案、質譜檔案、波峰數據檔案）。可提供使用者進行資料視覺化、波峰調整與註釋、資料前處理、品質管制、批次效果偵測、關聯性分析，最終找出重要的與疾病狀態、藥物代謝、臨床診斷、毒性反應、飲食營養等等相關的代謝物。（說明網頁）
      • 統整P值分析軟體 (OPATs)：OPATs主要設計來分析基因型資料或p-value資料。可提供使用者進行多位點的關聯性檢定來定位致病基因，找出與疾病相關的基因體片段、功能基因、生物反應路徑。（說明網頁）
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